Ved hver enkeltreise skal pasienten betale en egenandel fastsatt i pasientreiseforskriften § 24. Det vil si to egenandeler for en tur/returreise. Satsen for egenandelen står i § 24 første ledd.
Nære pårørende som får reisestønad etter pasientreiseforskriften § 19 skal også betale egenandel.
Ved reise med drosje eller annen transport som er organisert av Pasientreiser , skal det beregnes en egenandel per person. Hvis en pasient bruker flere transportmidler på reisen til eller fra behandlingsstedet, eller pasienten må overnatte på vei til eller fra behandlingsstedet, skal det bare betales egenandel en gang. Ved flere behandlinger som følger etter hverandre (seriebehandling) skal også egenandel trekkes fra. Det står mer om beregning ved seriebehandling under pasientreiseforskriften § 12.
Egenandelen kan ikke overstige faktiske kostnader. Det vil si at hvis drosjeturen koster 80,- kr, kan ikke drosjesjåføren kreve mer enn dette beløpet. Det kan kun trekkes egenandel fra reiseutgifter, ikke for eksempel utgifter til kost eller overnatting.
Gravide er ikke fritatt for egenandel i forbindelse med reiser til kontroll, ultralyd og lignende.